Трое детей семьи Бодлер — Вайолет, Клаус и Солнышко — после пожара остаются сиротами и оказываются на попечении графа Олафа, всеми силами пытающегося захватить наследство детей. В конце концов графа разоблачают, но наполовину. Дети всячески пытаются объяснить всем вокруг, что Граф Олаф не просто плохой опекун, но и еще пытается убить их для того, чтобы разбогатеть; разумеется, никто никогда детей не слушает. И только из-за непонимания детей взрослыми, сироты попадают в разные злоключения.

Их отдают доброму новому опекуну — ученому, увлекающемуся изучением змей, но замаскировавшийся под ассистента дяди Монти (опекуна), Граф Олаф убивает его, скрывая все доказательства своей вины. Позже детей отдают ещё одной опекунше, странной тете, боящейся буквально всего на свете, но и тут Граф обманывает бедную женщину и также хладнокровно убивает её, скармливая пиявкам.

Граф пытается жениться на Вайолет, шантажируя её смертью Солнышко. Вайолет выходит за него замуж, но благодаря ловкости и смекалке, сироты находят выход из положения и уничтожают брачный договор. Граф разоблачён и его заставляют вынести все те беды, которые он причинил Бодлерам, после наказания он скрылся.

В конце фильма сироты вместе с мистером По приезжают на то место, где когда-то был их дом. В почтовом ящике они видят письмо от родителей, в конверте кроме письма находится еще и подзорная труба — реликвия семьи Бодлер.