Мультфильм снят по известной сказке Корнея Ивановича Чуковского про доброго доктора Айболита.

Доктор Айболит — очень добрый ветеринар, который всегда готов оказать помощь всем, кто в ней нуждается. В этом ему помогают его коллеги: мартышка Чичи, свинка Хрю-Хрю, Крокодил и другие.

Однажды Айболит получает телеграмму о том, что в Африке разразилась страшная эпидемия и все обезьяны заболели. Немедленно прибыв в Африку, Айболит и его друзья оказались жертвами нападения злого разбойника Бармалея и его дружков.

Однако, по иронии судьбы, у Бармалея оказались больные зубы, и когда Айболит ему их вылечил, Бармалей стал другим человеком. Хорошим. У каждого из остальных разбойников тоже что-то болело, поэтому для них организовали госпиталь, и вылеченные злодеи сразу подобрели.